La única contraindicación absoluta es que el paciente tenga dispositivos metálicos implantados o no extraíbles en la cabeza (placas metálicas, Implantes cocleares, válvulas de derivación de líquido cerebro-raquídeo, clips o coils de aneurismas).

Tampoco se puede utilizar en pacientes con implantes controlados como marcapasos, desfibriladores implantables, estimuladores del nervio vago, estimuladores medulares o bombas de infusión de fármacos.

Como contraindicaciones relativas (en las que habría que estudiar el caso en profundidad para tomar una decisión) encontramos:

• Epilepsia/convulsiones en el pasado
• Esclerosis Múltiple
• Mujeres embarazadas

Por lo general son leves y mejoran poco después de la sesión y tienden a mejorar con el paso de las sesiones. Entre ellos tenemos los siguientes:

• Dolor de cabeza.
• Incomodidad en la zona de estimulación del cuero cabelludo.
• Sensación de hormigueo, espasmos o movimientos espasmódicos de los músculos faciales.
• Aturdimiento (aumento de la agudeza auditiva).